Alveoles permettant de cultiver des bactéries dans le sol.
Environ 25 000 personnes par an, rien qu’en Europe, meurent d’infections résistantes aux antibiotiques. Mais l'utilisation massive et répétée de ces médicaments génère une hausse des résistances bactériennes dans le monde entier, favorisant la réémergence et la propagation d’infections et de maladies contre lesquelles on se croyait protégé. Or l’arrivée de nouvelles molécules fait cruellement défaut. Grâce à une nouvelle approche, une équipe de chercheurs américains et allemands a identifié un antibiotique prometteur, baptisé Teixobactin. Ce nouveau composé pourrait agir plus rapidement que les médicaments existants, tout en étant efficace contre certaines bactéries multirésistantes.

Une méthode venue du sol

Methode qui a permis de trouver le Teixobactin
Pour identifier cette nouvelle molécule, le Pr Kim Lewis et son équipe de l’université de Northeastern, à Boston, ont utilisé une méthode encore peu répandue. Les bactéries du sol constituent une ressource sous-exploitée dans la recherche de nouveaux antibiotiques. Les chercheurs ont eu l’idée d'en cultiver, non pas sur un substrat standard, mais dans leur environnement originel. Pour cela, ils ont eu recours à un système nommé iChip, breveté par la société américaine NovoBiotic, leur permettant de cultiver 10 000 bactéries dans la terre. En confrontant les bactéries du sol à des bactéries pathogènes comme le staphylocoque doré, ils sont parvenus à identifier celles contenant des molécules capables de les tuer. Cette méthode a permis d'isoler 25 antibiotiques dont le plus prometteur, selon le Pr Lewis, est le Teixobactin.

Efficace contre la tuberculose

Les tests de laboratoires parus le 7 janvier dans la revue Nature montrent que le Teixobactin, testé sur des souris, est capable de tuer les bactéries aussi rapidement qu’un autre antibiotique, la Vancomycine, utilisée pour lutter contre les mêmes infections. De plus, toujours sur les souris, l'utilisation de cette molécule n'entraîne pas d’effets secondaires. Le Teixobactin est particulièrement actif contre les bactéries dites à Gram positif telles que le staphylocoque doré (Staphylococcus aureus), la tuberculose (Mycobactérium tuberculosus) ou encore le Clostrodium difficile, responsable de diarrhées. « Mais, précise le professeur Patrice Courvalin de l’Institut Pasteur, il reste sans effet sur les bactéries à Gram négatif comme Escherichia coli et les entérobactéries », infections en constante augmentation depuis 10 ans.
Il a fallu 30 ans pour qu’une résistance à la Vancomycine émerge. Les auteurs de l’étude espèrent que l'apparition de la résistance à ce nouveau médicament prendra davantage de temps encore. Reste que ce nouvel antibiotique n’a pas encore été testé sur l’être humain. Il faut donc vérifier son efficacité et l'existence éventuelle d’effets secondaires. Le Pr Lewis, qui a dirigé l’étude, est quant à lui confiant. Il déclare que les premiers essais cliniques sur l’Homme pourraient commencer dans deux ans et qu’en cas de succès, le médicament pourrait être utilisé dans dix ans.

Les différentes orientations de la recherche

La découverte d'antibiotiques a connu son âge d’or entre 1940 et 1960. À cette période, les scientifiques se penchent sur l’étude des microbes vivant dans le sol afin de produire des toxines chimiques pour lutter contre les bactéries pathogènes. Plus récemment, dans les années 1980, la recherche, orientée vers la conception de molécules de synthèse dérivées ou non d’antibiotiques naturels, a abouti à la découverte de nouveaux médicaments, mais à peu d’antibiotiques. Les chercheurs se tournent désormais vers d’autres méthodes et retournent à l’exploration du sol.